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深圳市華大海洋研究院隸屬于深圳華大海洋科技有限公司，長期圍繞水產基因組學、分子育種、海洋藥物研發和海洋基因庫建設等方向，開展系列的產學研工作。已建有深圳市海洋生物基因組學重點實驗室、廣東省海洋經濟動物分子育種重點實驗室、深圳市(海洋藥物)院士工作站等科技研發平臺。華大海洋研究院多次參與國家及省市重點項目實施，主持和參與完成了包括彈涂魚、大黃魚、金線鲃、金龍魚、海馬等 70 多個重要經濟水產動物的基因組測序與分析工作，占到全國總量的 1/3 以上。海洋研究院于 2012 年，在中國科學院大學華大教育中心開啟了全國首個海洋生物基因組學的碩士生與博士生培養工作。
華大海洋質量安全檢測實驗室獲得了中國計量認證（CMA）、中國合格評定國家認可委員會實驗室認可（CNAS認證）、農產品質量安全檢測機構考核證書（CATL）及ISO9000質量體系認證證書，具有出具公正性報告的資格，并與政府主管部門、科研單位、相關企業、合作社、農戶等各主體建立了良好的合作關系。
華大海洋已建成長江流域種質資源庫，總面積3000平方米，包括樣本庫、數據庫、科普展示中心。華大海洋逐步收集并完善水生生物的生物學數據、組學數據、養殖數據、種業數據、市場數據和產業數據，通過水產大數據中心的分析運行，實現數據查詢、數據分析、技術服務、市場趨勢分析和產業發展咨詢等增值服務。