De SBNE en haar rechtsvoorgangers hebben sinds 2004 gestreden tegen bouwplannen op het Spelderholt. Vanaf 1990 deden Het Gelders Landschap, de Gelderse Milieufederatie en de Stichting werkgroep Milieuzorg Apeldoorn hetzelfde bij eerdere bouwplannen. Dit heeft in 1992, 1998, 2010 en 2011 geleid tot vernietiging van beschikkingen, vergunningen of plannen door de Raad van State. Het doel was steeds het behoud van de natuur-, cultuurhistorische en landschappelijke waarden van de Beekbergense enken en van het a
De SBNE zal uitvoering van bouwplannen en inrichting van het landschap blijven leggen naast de bij het plan door de gemeente en de projectontwikkelaar na veel strijd verkregen toezeggingen. Deze zijn vastgelegd in een projectbesluit samen met de inhoud van het door de Raad van State vernietigde bestemmingplan Spelderholt-Riant met bijbehorende documenten, natuurbeschermingswetvergunningen en geldend beleid en regelgeving.
Een doorn in het oog van de SBNE is de sinds 2011 voortdurende kaalslag van de vegetatie op het terrein van het Spelderholt, waardoor ook de fauna geschaad wordt. De natuurbeschermingswet eist dat uiterlijk drie jaar na het kappen herbeplanting plaatsvindt. Herbeplanting is voor het Landgoed in een landschapsinrichtingplan vastgelegd en als voorwaarde bij een in 2010 door de Gemeente Apeldoorn verleende kapvergunning opgenomen. De projectontwikkelaar moet haar in een overeenkomst vastgelegde herplantplicht